空间组学
INTRODUCTION
简介

在生物体内,细胞在三维结构中相互作用和组装,每个细胞的位置与其内在特性一样重要,并且其功能受到周围微环境的影响。空间上蛋白组/转录组等多组学的研究,有助于我们更全面地理解生物体内的分子机制、生物过程和疾病发生发展。2022年,空间多组学技术被Nature杂志评为7大“颠覆性”技术之一。顿慧医疗拥有以下几个蛋白/mRNA的空间表达研究技术。

D-Mind mIHC DigiPatho (D-Mind)

D-Mind mIHC DigiPatho是顿慧医疗开发的一款集病理切片的HE染色、多重免疫荧光染色(mIHC)和人工智能数字病理图像分析于一体的数字病理学工作流程全面解决方案。D-Mind mIHC DigiPatho分为basic panel和basic+X panel。Basic panel的标志物包括CD3、CD4、CD8和PD-L1;basic+X panel是在basic panel上再增加1-2个标志物,如PanCK、CD68、FoxP3、CD31、CD20、CTLA4、PD-1和Tim-3等。D-Mind mIHC DigiPatho平台基于全自动多光谱成像系统可实现图像的快速高分辨率扫描,同时基于人工智能技术可以对整张切片上的不同细胞亚型进行识别和统计,进而可以检测肿瘤组织样本中的各类微环境细胞的数量及密度、肿瘤边缘浸润度、细胞间空间关系信息。基于以上功能,D-Mind mIHC DigiPatho平台可以在空间维度精准评估肿瘤组织免疫微环境状态,辅助预测患者对免疫检查点抑制剂的应答,从而为临床免疫治疗方案制定、患者预后预测等提供更多的参考信息。除此之外D-Mind mIHC DigiPatho平台也可用于各种肿瘤基础研究。

HALO数字病理分析平台

HALO具有简便的、可扩展的、超性能的、快速的分析性能,能够对 IHC 和 IF等多种病理扫描切片进行定量分析、细胞聚类分析、细胞空间分析、连续切片叠加分析等多种分析功能。HALO AI进一步优化细胞核识别、细胞膜分割、组织分类等功能,使HALO分析更快速、准确,并拓宽HALO的分析范围。

GeoMx Digital Spatial Profiler(DSP)

GeoMx DSP可在组织原位检测分析转录组和蛋白组的一种技术,与传统方法相比,DSP将病理影像与测序数据结合在一起,进而分析组织切片内部空间结构的细胞异质性,有助于解决重大的生物科学问题。GeoMx DSP 每天可从多达 12 个组织载玻片展示高至全转录组的基因表达谱和多达 100 种经过验证的蛋白质表达谱。